Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp11Q02853 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms