Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp1Q01514 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms