Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2aQ01320 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Top2aQ01320 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2aQ01320 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms