Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2bQ01097 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Grin2bQ01097 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Grin2bQ01097 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms