Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smn1P97801 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms