Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata5P97489 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata5P97489 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata5P97489 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms