Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp1P97350 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms