Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otx1P80205 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otx1P80205 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms