Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vamp7P70280 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp7P70280 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms