Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SbdsP70122 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SbdsP70122 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms