Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms