Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11aP62492 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms