Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufm1P61961 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms