Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Depdc5P61460 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Depdc5P61460 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms