Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chp1P61022 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Chp1P61022 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms