Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf2P59222 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms