Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr8P58682 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr8P58682 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr8P58682 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms