Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gp1bbP56400 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms