Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Faf1P54731 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Faf1P54731 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms