Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PctpP53808 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PctpP53808 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PctpP53808 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PctpP53808 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PctpP53808 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PctpP53808 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PctpP53808 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PctpP53808 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PctpP53808 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PctpP53808 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PctpP53808 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PctpP53808 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PctpP53808 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PctpP53808 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PctpP53808 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PctpP53808 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms