Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtbP53612 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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RabggtbP53612 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RabggtbP53612 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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