Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Map3k1P53349 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Map3k1P53349 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms