Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms