Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XpcP51612 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XpcP51612 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XpcP51612 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XpcP51612 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XpcP51612 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XpcP51612 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XpcP51612 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XpcP51612 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XpcP51612 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XpcP51612 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XpcP51612 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
XpcP51612 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XpcP51612 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XpcP51612 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XpcP51612 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms