Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LtbrP50284 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms