Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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