Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Brca1P48754 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brca1P48754 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms