Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LtbP41155 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtbP41155 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LtbP41155 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtbP41155 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbP41155 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms