Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pola1P33609 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pola1P33609 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola1P33609 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola1P33609 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola1P33609 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms