Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx1P31315 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms