Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CftrP26361 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CftrP26361 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CftrP26361 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CftrP26361 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CftrP26361 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CftrP26361 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CftrP26361 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CftrP26361 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CftrP26361 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CftrP26361 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CftrP26361 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CftrP26361 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CftrP26361 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CftrP26361 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CftrP26361 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CftrP26361 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CftrP26361 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CftrP26361 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CftrP26361 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CftrP26361 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CftrP26361 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CftrP26361 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CftrP26361 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CftrP26361 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CftrP26361 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CftrP26361 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CftrP26361 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CftrP26361 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CftrP26361 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CftrP26361 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CftrP26361 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CftrP26361 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CftrP26361 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CftrP26361 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CftrP26361 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CftrP26361 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CftrP26361 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CftrP26361 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms