Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnna1P26231 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnna1P26231 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnna1P26231 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnna1P26231 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnna1P26231 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms