Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cdk11bP24788 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms