Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bmp4P21275 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmp4P21275 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms