Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fcer1aP20489 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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