Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NefhP19246 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NefhP19246 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefhP19246 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefhP19246 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefhP19246 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefhP19246 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NefhP19246 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NefhP19246 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NefhP19246 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NefhP19246 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NefhP19246 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NefhP19246 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefhP19246 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefhP19246 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NefhP19246 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefhP19246 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NefhP19246 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NefhP19246 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms