Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms