Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl1P12850 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms