Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms