Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms