Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01636 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01636 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01636 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01636 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01636 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01636 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01636 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01636 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P01636 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01636 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
P01636 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01636 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01636 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01636 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01636 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms