Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Robo1O89026 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Robo1O89026 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Robo1O89026 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Robo1O89026 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Robo1O89026 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Robo1O89026 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Robo1O89026 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms