Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tom1O88746 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tom1O88746 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tom1O88746 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tom1O88746 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms