Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtogO55225 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtogO55225 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OtogO55225 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OtogO55225 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtogO55225 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtogO55225 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OtogO55225 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OtogO55225 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtogO55225 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtogO55225 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtogO55225 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtogO55225 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtogO55225 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms