Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp10aO54827 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Atp10aO54827 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp10aO54827 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp10aO54827 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp10aO54827 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp10aO54827 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp10aO54827 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp10aO54827 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp10aO54827 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp10aO54827 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp10aO54827 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp10aO54827 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp10aO54827 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp10aO54827 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp10aO54827 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Atp10aO54827 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Atp10aO54827 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Atp10aO54827 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Atp10aO54827 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Atp10aO54827 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp10aO54827 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp10aO54827 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp10aO54827 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp10aO54827 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp10aO54827 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp10aO54827 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp10aO54827 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms