Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TnxbO35452 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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TnxbO35452 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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TnxbO35452 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TnxbO35452 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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TnxbO35452 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TnxbO35452 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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