Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms