Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dctn1O08788 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dctn1O08788 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms