Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckarO08786 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckarO08786 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckarO08786 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckarO08786 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckarO08786 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckarO08786 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckarO08786 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckarO08786 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckarO08786 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckarO08786 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckarO08786 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckarO08786 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckarO08786 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckarO08786 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckarO08786 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckarO08786 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckarO08786 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CckarO08786 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms