Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20878L7N244 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20878L7N244 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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